В теории конечно можно представить, что один из разумных видов, отделившись от основной эволюционной линии, долгое время развивался параллельно в условиях супер-изоляции (на удаленном материке, например). А к моменту, когда технические средства смогли обеспечить контакт с ним, в обществах уже развились гуманистические идеи, препятствующие уничтожению себе подобных.
Совместная же эволюция (коэволюция) двух видов на одних и тех же территориях представляется маловероятной ввиду того, что "разумные" виды легко организуют массовое сородичей просто из-за того, что те носят другие шляпы.