Может.
Самоповреждение определяется не конкретными действиями, а мотивами (то есть, почему человек это делает) и результатом (то есть зачем он это делает, что получает).
Поэтому курение может быть как осознанной формой отдыха, расслабления, способа размышлений, так и самоповреждением. Но в большинстве случаев это просто зависимость.
Нет, это вредная привычка, но она не является самоповреждением. Далеко не у всех курильщиков легкие портятся настолько, чтобы они от курения и умирали.