Однонуклеотидные замены являются, в сущности, мутациями, только нейтральными, которые с определенной частотой в норме встречаются в популяции и чаще не влияют каждая по отдельности на фенотип. Весьма часто можно встретить ассоциации множественных SNP с фенотипами, т.к некоторые фенотипы детерминируются крупными генными сетями (детерминанты полигенных мультифакториальных заболеваний), например, вовлеченными в патогенез артериальной
гипертензии, либо сложных наследственных
гиперхолестеринемий. Есть полиморфизмы, которые ассоциированы с повышенным риском мутаций гена или других генов, все очень индивидуально и многообразно. Так что полиморфизм может быть и
предиктором и связующим звеном, при этом он и сам - мутация. К слову, есть специальные методы дифференциации полиморфизмов и мутаций.