Чеки не хранятся на серверах ФНС буквально.
Прием, обработку и хранение данных, занимаются ОФД (Операторы Фискальных Данных)
ОФД — посредник между пользователем кассы и ФНС.
Их порядка 17 организаций, у одной кассы может быть только один ОФД.
Иногда ОФД, выкладывают определенную статистику (обезличенную) по продажам в определенный период и т.д
Отвечая на вопрос, то условно ФНС уже дает работать с этими данными, определенным сертифицированным организациям ОФД.