Согласно ст. 58 СК РФ, ст. 17 ФЗ "Об актах гражданского состояния":
Если Вы не состоите в зарегистрированном браке с матерью ребенка:
Да, если мать ребенка согласна, при его рождении вы можете подать совместное заявление, на основании которого Вас впишут отцом в свидетельство о рождении. Однако фамилия ребенку в этом случае будет записана по матери.
Если Вы заключили брак:
При подаче заявления в ЗАГС Вас по умолчанию запишут отцом.
Однако ст. 52 СК РФ дает право биологическому отцу оспорить отцовство в судебном порядке, причем данное право действует бессрочно.
О том, как происходит оспаривание отцовства, можно почитать здесь.