Если говорить о хемосинтезирующих организмах (хемолитотрофах), которые представлены немногими видами, встречающимися только среди прокариот (нитрифицирующие и водородные бактерии, серо- и железобактерии), то их можно признать тупиковой ветвью эволюции. Другое дело - хемоорганотрофы, или гетеротрофные бактерии (сюда относятся как сапрофитные бактерии, так и паразитические виды ). Эукариотическая организация клетки могла возникнуть в результате "поселения" в "теле" относительно крупных гетеротрофных прокариот (вероятно, каких-то архебактерий, не имеющих клеточной стенки) других видов бактерий (гипотеза симбиогенеза). Последние поначалу, вероятнее всего, являлись или объектами питания, или комменсалами. С течением времени отношения между клеткой-"хозяином" и "вселенцами" трансформировались во взаимовыгодный симбиоз (мутуализм). Так, древние аэробные бактерии, извлекающие энергию для жизнедеятельности в ходе окисления органических соединений , могли превратиться в митохондрии, древние фотосинтезирующие бактерии (фотолитотрофы) - в пластиды растительной клетки. Ну и далее, в ходе эволюции, от колониальных форм эукариот появились многоклеточные организмы (см. гипотезы Геккеля, Мечникова и др.)