Вопрос из серии "кто сильнее Акула или медведь?". Если отбросить все “Киношные” стереотипы о летающих ниндзя и самураях, разрубающих мечом каменные статуи, и обратиться к вроде как официальной истории, то мы получим двух представителей различных каст. Каста воинов, они же самураи, и каста убийц, то есть - ниндзя. В то время как одни постигали искусство владения мечом, другие учились убивать и оставаться незаметными. Из различных исторических данных известно, что развитая мускулатура, выделяющая воинов тени их из толпы обычных японцев, только мешала этим воином оставаться незаметными. Ниндзя тратили меньше времени на развитие своих физических показателей, больше полагались на различные уловки. Выдающиеся самураи тратили многие часы на упражнения с оружием (не только мечом, они изучали все доступное оружие, а так же безоружный бой), следовательно, их физические показатели были очень даже высоки. Следовательно, в физической силе, в теории, самураи превосходили ниндзя, речь именно про физическую силу. Что же касается боевого контакта, едва ли ниндзя вступали в честный бой против самурая, да и вообще против кого-либо. В любом случае боя, где один неистово машет мечом, а другой метает в него отравленные сюррикены, никогда бы не состоялся. Но если мы возьмем "вакуумное пространство", откинем все возможные противоречия, и в чистом поле выставим двух среднестатистических бойцов (самурая и ниндзя), то с вероятностью почти в 100% самурай одолеет ниндзя в честном бою клинок на клинок. Естественно честного боя ниндзя никогда не допустит, он на это не учился.