Очевидно, тот, кто установил новую версию вместо бывшей у вас с момента установки вплоть до обнаружения несакционированного доступа к ПО. Непосредственно версии Яндекса меняют его разработчики, кто это сделал на вашем устройстве, конкретно сказать никак невозможно, по крайней мере, без специального расследования происшествия как детективного, что вряд ли осуществимо в рамках сервиса "Яндекс.Кью" среди обычных пользователей, не наделённых какими-либо особыми привилегиями.