Один из способов:
Пара пакетиков чая решат проблему. Просто положите их внутрь обуви на ночь. Разумеется, сухие и неиспользованные
Другой:
Положите неприятно пахнущую обувь в полиэтиленовый пакет и поместите его на ночь в морозильную камеру. Замораживание убивает большую часть бактерий, «ответственных» за запах