Добрый день!
Военнослужащий не может отказаться от служебной командировки, т.к. военная служба не предусматривает возможности отказа от исполнения приказа. В случае немотивированного отказа от убытия в командировку, он подлежит дисциплинарной ответственности, в связи с уклонением от исполнения обязанностей военной службы (п.2 ст. 28.5 ФЗ от 27.05.1998 № 76 "О статусе военнослужащих").
Вместе с тем, есть уважительные причины, при которых в служебную командировку не направляют, но они должны быть поданы командиру в виде мотивированного рапорта:
Спасибо за вопрос!