Хочу начать читать комиксы от "Марвел" по фильмам, начиная с "Железного Человека" 2008 года. С чего мне начать? Как продолжать?

Комиксов нет, киновселенная Марвел - это отдельное ответвление (это вселенная, и на самом деле не одна) комиксы тут только основа.

Из-за очень большого количество ответвлений, спин-оффов, кроссоверов, переосмыслений, из-за разных авторов и времени написания комиксов, из-за желаний авторов привнести что то свое, появилось огромное количество несостыковок, какие то герое и события хоть как то вписывались в канву, какие то нет. 

Фанаты даже разделили все вселенные  на номера (туттеория). Поэтому все что показано в кино выделено в отдельную вселенную.

Вся серия про Мстителей это "вселенная" Земля-199999. Про Людей ИКСЗемля-10005. Далее будет Трэш.

Например после события фильма «Люди Икс: Дни минувшего будущего» появилась новая вселенная Земля-TRN414, своя хронология, где можно лепить, что угодно, до этого события Людей Икс развивались в во вселенной Земля-10005 (раньше кстати, первые три фильма про людей икс выделяли в отдельную вселенную). Так как фильмы про Мстителей это Земля-199999, как вы видите, события там не перекликаются. А фильм Логан (2017) это уже Земля-17315, за основу взят сюжет комикса кроссовера Старик Логан - Земля-807128. 

Скоро выйдет Вином, были слухи, что это будет спин офф Человек-паук 3: Враг в отражении - (Вся трилогия с Тоби Магуайром - это Земля-96283), но слухи не подтвердились, Новый человек паук с Эндрю Гарфилдом можно вообще забыть как страшный сон с Земле-120703. Есть надежды что он впишется во вселенную Земля-199999 где существует Человек Паук от Тома Холланда, хотя он может стать очередным ответвлением если авторы опять переборщат  со сценарием.

За это скажем спасибо эгоизму сценаристам и киноделам, которые не могут договориться и лепят каждый своё.

А теперь вывод - вселенная Земля-199999 появилась именно с выхода фильма про Железного человека, пройдя по ссылке, можно увидеть все проекты которые должна объединять общая хронология. Основой для всех этих фильмов служит основная вселенная Marvel Земля-616 немного проскальзывают и события из Земли-1610.