Какого-либо отдельного механизма для взыскания алиментов с самозанятого не предусмотрено.
Дополнительно об определении суммы алиментов читайте здесь.
Самозанятые сами производят выплаты:
Подробнее о способах выплаты алиментов тут.
В случае образования задолженности получатель предъявляет соглашение или решение суда приставам, и они осуществляют принудительное взыскание.