Если рассматривать компьютер, как систему, а его материнскую плату, как подсистему, то, очевидно, что на ней выполняется львиная доля вычислений.
Если провести декомпозицию дальше, и рассмотреть как систему саму материнскую плату, то главной микросхемой будет чипсет, ведь это он осуществляет коммутацию всех информационных потоков, но вот вычисления выполняются на процессоре. Если же в материнскую плату установлен видео-адаптер, то скорее всего, что производительность в гига-флопсах будет выше у него.
Но! Но всё зависит от задачи, которую решает компьютер. В 3-d играх и при расчёте криптовалют - основные расчёты на внешней видеокарте. Если же задачи офисного характера, где графика не особо нужна, а нагрузку создаёт лишь антивирус при проверке открываемых файлов и web-страниц, то, конечно, процессор.