Всего в озере Инле водится несколько видов рыб, из них часть эндемичные: красноносая расбора (савбва), изумрудная микрорасбора, красная карликовая расбора, данио инле, голец инле (юннанилус бревис), угорь, мраморный клариевый сом, лягушковый клариевый сом.