Да самые разные:
текстовые редакторы для написания документов.
табличные редакторы - для расчётов задолженности, пеней и пр.
базы данных нормативных актов (Консультант+, Гарант и пр.)
программы налоговой для формирования и подачи документов на регистрацию ЮЛ и внесение изменений.
Кроме всего прочего, сейчас много он-лайн инструментов для работы: облачные дисковые пространства для работы с документами, конвертеры документов, он-лайн отправка писем и пр.