Для интернет-магазина подойдет любая касса, соответствующая 54ФЗ. Вопрос в другом – нужна ли вам будет реальная касса на руках? Если есть собственные пункты выдачи или курьерская доставка, - то нужна. Если оплату принимаете только на сайте, то можно обойтись облачной.
Если ваш вариант – первый (с доставкой и пунктами выдачи), то лучше выбрать кассу, которая сможет одновременно обслуживать онлайн-оплаты и печатать чеки на выдаче. Тогда не придется содержать одновременно 2 аппарата для онлайна и офлайна. Сможете неплохо сэкономить. У меня похожая ситуация, есть магазины и есть сайт. Касса из магазина проводит оплаты с сайта, очень удобно. Пользуюсь кассами мтс.