Необходимо подъехать на заправку, взять в бардачке автомобиля топливную карту, выбрать в приложении Яндекс.Драйв опцию "заправиться"
Затем посмотреть сумму, на которую следует заправиться (в приложении), и сообщить эту сумму кассиру АЗС. Расплатиться топливной картой, и произвести заправку.
За заправку, кстати, Яндекс сделает хорошую скидку на поездку.