Для того, чтобы удалить фото из архива Яндекс.Диска, нужно кликать по каждой фотографии правой кнопкой мыши и переносить ее в корзину, нажав "Удалить". Потому нужно еще корзину очистить, чтобы удалить окончательно.
Было бы так просто, то и вопросов не было бы.