Создать самостоятельно проект двухэтажного дома, конечно, можете, но вот узаконить его вряд ли. Необходимо будет доказать, что у вас все правильно просчитано и выверено. Проще обратиться в проектную организацию полного цикла и уже вместе с ними создать индивидуальный проект. Проектировщики учтут все пожелания, как правило они всегда это делают создавая проект по индивидуальному заказу.