В ответ на требования налогового органа можно ответить так: на требование номер дата сообщаю, что доходы составляют (сумма) руб, расходы составляют (сумма) руб. В декларации показатели указаны верно.
Если налоговый орган не устроит такой ответ, то налоговая запросит книгу доходов и расходов и возможно первичные документы.