3 компа будет явно маловато для суперкомпьютера, посмотрите хотя бы на архитектуру "Багета".
Вообще-то в домашних условиях можно навтыкать побольше графических карт в один системник, как это делают биткойнеры: в них и процессорных ядер по несколько сотен, и ОЗУ иногда в несколько раз побольше компьютерного. То есть графические карты сегодня - очень маленькие суперкомпьютеры. Главное - найти приложение, которое смогло бы эти возможности карт использовать. Например, для вычислений можно применить Matlab.
)