Kali linux скачивается в обычных iso образах. То есть вы можете записать этот iso образ чем вы привыкли записывать загрузочные iso образы на флешку. Естественно с учетом того, для какого компьютера вы подготавливаете флешку и в каком режиме будет происходить загрузка. Я чаще всего использую программу Rufus, хотя есть и много других. Можно и просто переписать файлы, а потом сделать флешку загрузочной.