Собственные проекты считаю должны быть обязательно, ведь где ещё пробовать разные методики, стратегии, где проверять апдейты поисковых систем. Главное, чтобы не было конфликта интересов, что, увы, случается. Самая частая ситуация, специалист занят своим проектом, ему поступает задача от руководителя, но приступить к ней ASAP он не может, так как делает ответственную работу для себя. Но тут скорее проблема тайм менеджмента и планирования времени. Если специалист может разделить работу и собственные проекты, умеет правильно расставить приоритеты и главное, по итогу не страдает результат, то никаких минусов не вижу в этом