Если пароль на сам архив и пользователь не знает пароль, то он посмотрит на архивный файл - и ничего с ним не сделает.
Если пароль на сам архив и пользователь знает пароль от архива, то он извлечет файлы из архива, введя пароль.
Более от архиватора ничего не зависит.
Если в архиве файл, например, MS Excel, то средствами Excel можно установить пароль на этот файл (независимо от того будет ли он потом архивироваться или нет. и если будет, то будет ли архивный файл с паролем или нет).
Для защиты файлов от изменения используют:
электронно-цифровую подпись (например, в банке на директора для доступа к клиенту-банка и получения/подписания документов в клиент-банке; или для обмена с ИФНС, ПФР, ФСС отчетностью, заявлениями, актами сверок, получения требований и т.п.; или для обмена счетами/актами/накладными с другими юрлицами и ИП - поставщиками и клиентами - сервис ЭДО /электронный документооборот/; также ЭЦП может использоваться для доступа к кабинету налогоплательщика в ИФНС; для участия в торгах). По аналогии можно не архивировать а именно шифровать любые документы (файлы) с помощью ЭЦП и передавать их получателю. Получатель же, зная ключ для расшифровки расшифровывает полученные документы и использует по своему усмотрению. Наличие или отсутствие архиватора тут роли не играет.