Напишу банальную вещь, но это правда: легче заранее подготовиться и правильно провести знакомство кошек, чем потом долго работать над ошибками и разнимать кровавые драки.
В вашем случае нужна помощь зоопсихолога, который должен разобраться в сути конфликта и помочь "заново", в несколько этапов перезнакомить кошек.