Например «из Магадана» или «с Магадана»? Где-то я увидел, что это определяется вопросом «куда?», если используется «на», то правильно «из Магадана». Но я не знаю когда говорить «в» или «на».
Здесь все довольно просто: с городами и странами - В и ИЗ, с местностями и водоемами - НА и С (Камчатка, Чукотка, Волга, Черное море). Отсюда и политические споры про В/НА Украину, кто-то ее хочет считать не страной, а областью.
С учреждениями и зданиями - В и ИЗ (в школу), с занятиями - НА и С (на урок, на тренировку).
Здесь всё максимально доступно и по полочкам: https://orfogrammka.ru/OGL02/70091276.html#id-45%D0%A3%D0%BF%D1%80%D0%B0%D0%B2%D0%BB%D0%B5%D0%BD%D0%B8%D0%B5-%C2%A7199%D0%92%D1%8B%D0%B1%D0%BE%D1%80%D0%BF%D1%80%D0%B5%D0%B4%D0%BB%D0%BE%D0%B3%D0%B0