При сдаче экзамена на новую категории (или несколько категорий) Вы оплачиваете только госпошлину за выдачу водительского удостоверения. После сдачи Вам выдадут одно водительское удостоверение, потому и пошлину надо оплачивать один раз. Если в ГИБДД потребую два раза оплачивать - требуйте письменный отказ.
UPD Ссылка на услугу https://www.gosuslugi.ru/10056/5
С вашими уверениями дошла до начальника отделения ГИБДД. Так вот, получить сразу одно ВУ с двумя категориями... Читать дальше