На самом деле не стоит делать этого "руками", лучше всего использовать специальное программное обеспечение для таких целей. Например популярный C-Cleaner, дабы не "убить" систему вовсе.
Windows не разрешает чистить реестр C-Cleaner, после такой чистки может понадобиться переустановка системы.