Питон можно в биоинформатики можно использовать по-разному, в зависимости от того, что вам нужно автоматизировать. У питона есть замечательные библиотеки, предназначенные для обработки данных. Ученые различных областей в своей работе пользуются Python. Это такие библиотеки, как NumPy, SciPy. Первая - это обработки данных, вторая - для посторения математических моделей. Также еще можно посмотреть на Pandas, которая связана с NumPy.