Он не выжил.
Безусловно, Моффат может выкинуть все, что угодно, однако до сих пор все предпосылки вели именно к этому. Целая "Безобразная невеста" была посвящена именно этому: как мог человек выжить, вышибив себе мозги? И ответ: никак. Однако один человек не значит ничего, если за его спиной стоит Организация.
Люди, преданные Мориарти, будут продолжать его дело, даже если лидер мертв: он наверняка оставил все необходимые инструкции на случай, если его план не сработает.
Если он только выжил, а не появился для:
Подразнить фанатов;
Сняться в флэшбэках.
И вообще, "нет ничего более обманчивого, чем вполне очевидный факт" (Ш. Холмс - А.К. Дойл).
Мориарти мёртв. А тот момент, когда они встретились с Эвр произошёл уже давно, когда Мориарти ещё жил. И весь этот разговор это просто воспоминание.