Если вуз находится далеко от вас, то лучший вариант - отправить документы по почте (электронной или обычной - на ваше усмотрение). Если вуз проводит дополнительные вступительные испытания не в дистанционной форме, то нужно приехать и подать документы лично. Также стоит оценить свои шансы на поступление в определенный вуз и лично оставить оригинал аттестата там, где вероятность поступления выше.