ВПЧ лечить целесообразно лишь в том случае, когда имеется высокая вирусная нагрузка (количественный анализ ПЦР на ВПЧ высокого и среднего онкогенного риска) и клинические проявления ВПЧ-поражения (кондиломы на половом органе, в области ануса, на мошонке). При высокой вирусной нагрузке и клинических проявлениях первым этапом удаляются/прижигаются пораженные участки кожи и слизистых, назначается противовирусная и иммуномодулирующая терапия (Аллокин Альфа, Изопринозин, Панавир, Генферон). Если пораженные участки кожи не распространенные, то возможно местное применение противовирусных мазей - Вифероновая и Оксолиновая мазь.