Бездомные собаки как правило не идут на прямой конфликт.
Постарайтесь избегать ресурса, который для них очень ценен. Например, если они питаются на помойке - защищать эту помойку от вашей собаки они будут очень активно.
Территорию, на которой они спят и выращивают щенков - то же.
Бывает так, что какой-нибудь бездомный подросток уж очень активно нарывается. В этом случае может помочь струйный перцовый баллончик. Здоровье собаке он не испортит, только сделает очень неприятно. После пары применений собака запоминает, что к вам лучше не подходить - хуже будет.