Во-первых, они у вас не атрофируются, упаси боже! Вот когда пациент лежачий, и лежачий долгое время, прикован к постели, вот тогда у него настоящая атрофия мышц, такая, что во время реабилитации (если она, конечно, имеет место быть) он учится заново ходить. Если же вы просто перешли на сидячий образ жизни, то у вас происходит просто потеря мышечной ткани, но в пределах нормы.
Во-вторых, а почему же она теряется? Человеческий организм умеет получать энергию из белков, жиров, углеводов (БЖУ) и спиртов (ха, думаю, вы последнего не знали). В тоже время организм использует БЖУ и как строительный материал для клеток и синтеза различных веществ, например, гормонов, медиаторов и т.п. Так вот, разумеется, что между этими процессами есть конкурентная борьба. Если ваш организм не подвергается физическим нагрузкам, то белки будут уходить в мышцы только в том объёме, что нужен для поддержания их нормальной работы, так сказать, на минималках - поэтому при рационе, богатом белками, вам не грозит никакая атрофия или саркопения. Но основная часть белка пойдёт просто на переработку в энергию. В тоже время, сама мышечная ткань по себе - это же клетки, а они тоже не только производят, но и потребляют энергию и ресурсы. И если вы накачали себе мышцы, а потом просто забили и не занимаетесь, то организм ваш не видит смысла в том, чтобы вхолостую тратить белки и прочие полезные вещества на большие мышцы, которые не используются по назначению. Происходит более разумное перераспределение ресурсов в организме.