Априори, лучше работать в огромной компании, особенно если нет опыта. Насчет комфорта. Слишком много нюансов, вопрос некорректен.
Можно конечно работать с горящими глазами и в гараже- всем известны результаты (если конечно у Вас есть навыки Стива Джобса, или как минимум реальный проект). С точки хрения разумности первый вариант, если есть перспектива. Если перспективы нет-все равно первый вариант, чтоб знать не понаслышке, что такое огромная компания.