Был долг на сайте ФССП, а пристав угнал карту в минус на сумму задолженности. Куда в этом случае платить на карту или на сайте?

Без разницы. Но я бы платила через госуслуги, там можно посмотреть задолженность и ход производства. И всё зафиксировать. Если будете платить полностью, то без разницы.