Для государства крайне нежелательно возникновение таких партий, однако говоря о "прямой зависимости" стоит заметить, что на развитие сепаратистских настроений влияет множество факторов. Например, экономический.
Если региону невыгодно существование в рамках единого государства и наличествует представление (реальное или ложное) о том, что центр использует край ничего не давая взамен, то такие настроения возникнут вне зависимости от существования соответствующей партии. Также имеет значение пропаганда, как на уровне государства, так и от общественных движений и отдельных членов.
Этнорегиональная партия/политическое движение просто способно аккумулировать такие настроения и направить их в сторону активных действий. Как это случилось в случае чеченского народа.