Никакой иерархии нет. Вы изучаете работу в той программе, которая может помочь вам выполнять проекты по выбранному направлению. К примеру для дизайна web в основном используется Photoshop, но при этом используется и Ai для рисования иконок, логотипов и т.д. Для рисования каких-то этикеток, логотипов, упаковок используют CorelDraw. Одним словом программы используются по мере надобности. Изучать их не так сложно учитывая тот факт, что в интернете очень много туториалов.