Если школьники учатся по ФГОС, то эти предметы уже не входят в перечень обязательных. Вместо них в аттестате можно поставить единую оценку по предмету "Естествознание". В аттестат эти предметы ставят только в случае, если в 10-11 классе их изучали не менее 64 часов (в целом).
Таким образом, этих предметов не будет в аттестате, если они не изучались ни в 10, ни в 11 классе, а вместо них было Естествознание.