Да, начнёт. Недолгое, правда, время. Кислород с водородом образует взрывную смесь, а гелий здесь будет просто мешаться, т.к. химически инертный. Но взрыв будет не моментальным - планета всё же не кабинет химии, взрыв будет дольше. Так, знаете - как цунами движутся. Если словами объяснить проще... с космоса это будет святящийся растущий блинчик. Если планета достаточно большая - чуть позже начнёт расти дырочка по середине этого блинчика и будет растущая бараночка. Из видеоматериалов разве что это видео пришло на ум - хоть это и будет выглядеть иначе. В тот день погода будет жарче, да и давление подскачет. Вымрет всё живое, если оно есть на планете.
Если я правильно понимаю, в уме вы имели ввиду пропорции по объёму газов. В таком случае среагирует ровно половина объёма газов. В итоге будут пары воды, тот же гелий и кислород (половина от изначальной доли в атмосфере).
Ещё могут быть уточнения, например, в зависимости от того, что находится под атмосферой. Какой состав твёрдой части, может даже у такой планеты есть какой океан. И каковы её размеры. Всё такое.
Термоядерной реакции не будет, планета по определению недостаточно массивное небесное тело для её начала.
Я был бы безумно раз узнать (не на личном опыте), какой будет звук от этой вспышки. Это будет явно не скромное *ЧПОК* или *ХЛЮП*.
Что до "Кислород опустится вниз атмосферы, водород будет наверху." - газы всё же довольно хаотичные, и не будет чёткой грани между газами. И для планет с атмосферой свойственна конвекция газов (например, ветра). Да, водорода будет больше в верхних слоях, но горение происходить всё же будет.
И, пожалуйста, поосторожней с такими вещами. Межпланетный вандализм - это нехорошо. Из-за таких негодяев во вселенной и нет таких планет - все погорели уже.