Призывать в армию такого человека не будут в том случае, если во всех документах отмечено, что это больше не мужчина. Женщин в армию не призывают, и если вы, будучи мужчиной, стали женщиной, и у вас в паспорте и во всех документах отмечено, что вы теперь женщина, то никуда вас не призовут.