Здравствуйте, Вадим!
Если вы производите замену ДВС и при этом не меняете модель, а меняется по факту только номер ДВС, в таком случае подобная замена расценивается как ремонт и оформляется через заявление через ГИБДД.
Вам внесут запись в особых заметках о том, что была замена ДВС и его номер поменялся. Проблем с такими процедурами обычно не возникает.