Если я не зарегистрировала торговую точку в налоговой, но зарегистрируюсь в Меркурий, то узнают ли об этом в налоговой?

Добрый день. Да, базы данных Меркурия и ФНС синхронизируются. Помимо этого, для регистрации в Меркурии обязательно быть хозяйствующим субъектом, т.е. ИП или организацией, и иметь соответствующие документы.