Во-первых часть энергии мы используем заставляя её скапливаться в одном месте. И хотим чтобы она там и оставалась. Например чтобы построить дом, нужно поднимать кирпичи на высоту - и затраченная энергия перейдейт в потенциальную энергию этих кирпичей в гравитационном поле земли. И пока кирпичи наверху, энергия там и остаётся.
Во-вторых при работе часть энергии идёт на тепловые потери. И потом достать её оттуда уже невозможно из-за второго закона термодинамики