Если человек хорош в интеллектуальной деятельности (программирование, математика и тд), при этом не исключает, например, шовинистских взглядов, умен он или нет?

Определяют разные виды интеллекта; например, для этого есть тест структуры интеллекта Амтхауэра. 

Может быть отличный "математический" интеллект, а в плане бытовых отношений - уныло, или наоборот: отстающий в школе по всем предметам, но цепкий насчёт найти-достать-договориться.

Потом, шовинизм, как и высокомерие, и всякая ксенофобия, - это скорее вообще история не про интеллект, высокий ли, низкий ли.

Это про:

• иерархию: чувствовать себя выше, унижая очно или заочно других, заявлять себя как своего среди референтной группы, "дружа против кого-то"

• характерные для человека виды психологических защит: вытеснение с последующим обильным проецированием. Вытесняется много страха, что я "не такой", могу стать или оказаться "не таким", ничтожным, - и этот страх проецируется на окружающих с последующим очным или заочным обличением: это не я, я в порядке, всё это про них, не про меня!!

• Ну, например, знакомство: активный член ОНФ, который говорит "Я гомофоб!" и "Мы, русские, православные", и вся тема про особенность русских и неприязнь к другим нациям. При этом я вижу, что человек безусловно умный и по-своему порядочный. С выраженными восточными чертами лица, - это насчёт войнушки с собой и "мы русские, а нерусские - это они, я против них, я совсем-совсем не они". А гомофобство - нет, это вовсе не про латентный гомосексуализм обычно, это про нормальный подростковый страх насчёт себя "мужик/ не мужик".

• про понимание порядочности. Для нас с вами шовинизм - марает, а для кого-то - не-а. 

Ну, да. Это непростой опыт последних двух лет: что человек умный вообще-то, и признанный уважаемый профессионал, может написать в соцсети про проклятую "чёрную обезьяну". Не в Альцгеймере, нет... И продолжать быть умным человеком, сохранным во всех остальных областях.

Что ж, это часть сложности мира и сложности, противоречивости людей. Зрелость - в том числе в свою очередь не мазать тоже людей чёрной или белой краской, - а выдерживать эту сложность. Свою противоречивость (в каждом из нас её хватает). Противоречивость других.