Здравствуйте!
Нет, нельзя.
Так как официально отец ваших детей не является вашим мужем, то и имущество, которое он покупает, будет считаться его собственностью.
Федеральным Законом от 29 декабря 2006 года № 256-ФЗ "О дополнительных мерах государственной поддержки семей, имеющих детей" установлено, что жилое помещение, приобретенное с использованием средств (части средств) материнского капитала, должно быть оформлено в общую собственность родителей и детей с определением размера долей.
То есть, законом не предусмотрена покупка квартиры, которая не будет в собственности матери и ее детей.