Это специальный файл определенного формата, который выдается Центрами сертификации. Его особенность заключается в том, что на основе этого сертификата нельзя создать новый.
Например, есть Удостоверяющий центр сертификации, который выдает сертифкаты (№1). Есть промежуточные центры сертификации, которые на основе сертификата №1 создают свои сертифкаты (№2). На основе эти сертифкатов №2 создаются сертифкаты (№3) для "конечного продукта", например, сайта. Вот сертифкаты №3, на которых цеопчка заканчивается и называются корневыми. Цепочка сертификатов может состоят из двух, трех или более звеньев.
Для работы с казначейскими порталами качал тут серты https://root-cert.ru/ ГУЦ и ФК. Без них не подписывало, когда какой то промежуточный или корневой не установлен