Что делать, если одно приложение переименовалось в com.apple.mobileinstallation. Оно не удаляется и не обновляется. Перезагрузка не помогает.

Вам в Настройки - Основные - Хранилище - найти то самое приложение

Нажмите на него, выберите удалить и подтвердите действие, после чего зайдите в App Store и найдите удалённые приложения, чтобы скачать их заново, это исправит приложение в обычный вид, после чего его уже можно будет корректно удалить.