Возник бы конфликт в рамках дружбы - Гарри и Драко по натуре лидеры. (Тогда как в аналогичном случае Рон сразу согласился для себя быть вторым). Если бы Гарри поступил в Слизерин при этом, то он, скорее всего, в этом случае бы походил на молодого Тома Реддла, т.е. тянулся бы ко всяким магическим знаниям, и Малфой, как продвинутый в плане магического сеттинга, был бы в этом очень полезен.
Впрочем, в конце-концов до Малфоя бы дошло, что выигрывает от их дружбы больше Поттер, чем он. Плюс склонность к обидчивости у Малфоя привела бы к курсам 5-7 к конфликту, возможно - переделу общих друзей, где Гарри бы победил за счет харизматичности.
Еще один плевок в душу Драко случился бы тогда, когда его родители и прочие пожиратели захотели бы "взять Гарри на контроль", воспользовавшись привязанностью сына к Поттеру.
Таким образом Гарри получает тлеющий конфликт, к нему могли близко подобраться маги из свиты Темного Лорда, плюс растоптанная личность Драко Малфоя - ничего хорошего из такой дружбы бы не вышло.
Глобально, думаю, Крэбб выжил бы. Потому что не водился бы с Драко и не полез бы за ним в Выручай-комнату. Еще, возможно, бузинная палочка проделала бы несколько иной путь. А так, наверное, все.
Гарри все таки эмоционально и морально сильнее Драко, поэтому если бы они дружили, и Драко проникся бы к Гарри истиной дружбой, то могла развиться семейная трагедия у Малфоев. Как у Блеков, когда Сириус сбежал к Поттерам.
Возможное развитие событий подробно описано в трилогии Кассандры Клэр "The Draco Trilogy". Произведение, достойное хотя бы одного прочтения.