Патологоанатом работает в больнице и производит вскрытие умерших в больнице, а так же работает с секционным материалом (то, что удалили при операциях) и плацентами из роддомов. Работа спокойная, чистая.
Судмедэскперт работает с материалом, попадающим в той или иной степени в поле зрения правоохраниетелей: помимо чисто "криминальных" трупов сюда попадают люди, умершие на улице, дома -- в общем, вне больниц, найденные фрагменты и т.д.
Так же проводится и экспертиза живых лиц -- оценка тяжести травм в результате криминала, ДТП.
Порой работают с документами, а не с людьми.
Несколько по-разному даётся и заключение. Патологоанатом ставит диагноз, а смэ ещё и определяет направление удара, дистанцию выстрела и т.д.
И, да. Все ужасы вроде "гнилых трупов", про которые не-медик думает при словах "патологоанатом" -- это судебная медицина.
Ну и врачи обеих специальностей могут работать с микроскопом, а не с трупом. СМЭ часто ещё и в лаборатории. Ещё СМЭ ищут кровь и сперму на предметах...